Kao trener Sesveta ostvario je hvale vrijedan rezultat, izborivši plasman u Prvu HNL, ali, na žalost, klub nije mogao pratiti prvoligaške ambicije.
Bio je direktor nogometne škole GNK-a Dinamo, koja je pod njegovim vodstvom izrasla u europski priznati rasadnik vrhunskih nogometaša. Osim toga, Božidar Šikić imao je važnu ulogu u karijerama mnogih velikih hrvatskih igrača (Ćorluka, Modrić, Vrsaljko, Brozović, Badelj, Kovačić, Pjaca, Antolić…), čiji je talent prepoznao, a poslije uvelike utjecao i na njihovo nogometno sazrijevanje.
U igračkim danima Božidar Šikić branio je boje Zagreba i Lokomotive, u kojoj je danas jedan od glavnih nositelja uspješnih ukupnih djelatnosti. Lokomotiva je uz njegov značajan doprinos od četvrtoligaša postala stabilan prvoligaški klub, koji ostvaruje zapažene rezultate na domaćoj, ali i europskoj sceni.
Božidar Šikić jedan je od ljudi koji su utemeljili Međunarodni juniorski turnir “Mladen Ramljak”, a osim što je godinama uspješno djelovao u Zagrebačkom nogometnom savezu, član je Natjecateljske komisije i Komisije za profesionalni nogomet Hrvatskog nogometnog saveza. Od prosinca 2020. godine obnaša funkciju savjetnika predsjednika HNS-a, Davora Šukera.